气候
光照充足：宁夏中卫地区年日照时数平均可达 2854.9 小时，生长季节日照时数也较长，在 1080 小时左右，日照百分率在 65%，充足的光照为硒砂瓜的光合作用提供了良好条件，有助于植株生长和果实糖分的积累 。
昼夜温差大：中卫市属于典型的干旱气候，昼夜温差大，一般在西瓜成熟的关键时期，适宜的昼夜温差有利于瓜类作物干物质和糖份的积累，使得硒砂瓜甘甜爽口，糖分含量高，通常能达到 12% 以上 。
干旱少雨、蒸发强烈：年降水量约 200 毫米，而蒸发量高达 2000 毫米以上，当地农民通过发明压砂技术，即在土壤表面铺设一层砂砾，来减少水分蒸发，保持土壤湿度，以适应西瓜的生长需求 。
土壤
富含硒等微量元素：当地的砂石中含有大量的硒、锌、钙等微量矿物元素，在西瓜生长过程中，这些微量元素会被吸收，使得硒砂瓜富含多种对人体有益的矿物质，这也是其得名的重要原因 。
土壤质地特殊：种植硒砂瓜需在土壤表面铺设一层 15-20 厘米厚的砂砾混合物（砂、石混合物比例 3:7 或 4:6），这种砂砾覆盖的土壤既能够蓄水、保墒、压碱，又可以提高地温，为硒砂瓜的生长创造了独特的土壤环境 。
地形地貌
山坡地与丘陵地为主：硒砂瓜种植基地多位于山坡地和丘陵地，如中卫市环香山地区，这里山势起伏，沟壑纵横，为硒砂瓜的生长提供了独特的微气候环境，且远离城区和工矿业区，产地内无污染企业和其它污染源 。
